1、物流中心货物进入境内视同进口，按照货物实际贸易方式和实际状态办理进口报关手续；货物属许可证件管理商品的，企业还应当向海关出具有效的许可证件；实行集中申报的进出口货物，应当适用每次货物进出口时海关接受申报之日实施的税率、汇率。
2、货物从境内进入物流中心视同出口，办理出口报关手续。如需缴纳出口关税的，应当按照规定纳税；属许可证件管理商品，还应当向海关出具有效的出口许可证件。
3、货物从境内进入物流中心时，海关可以签发用于办理出口退税的出口货物报关单证明联的情况：
（1）货物从境内进入物流中心已办结报关手续的；
（2）转关出口货物，启运地海关在已收到物流中
