由国外运进或者由国内运出的集装箱，在最先到达口岸或者最后离开口岸的时候，承运人、代理人或者货主，必须向卫生检疫机关申请卫生检查或者卫生处理。
1．入境、出境集装箱的承运人、代理人或者货主在集装箱实施卫生检查以前，尽早向卫生检疫申报下列事项：
（1）预定到达或者离开口岸的日期和时间；
（2）装箱的地点和目的地；
（3）货物的各类、数量和包装材料。
2．对入境、出境集装箱有下列情形之一者，必须实施卫生处理：
（1）携带有病媒昆虫、医学动物的；
（2）载有腐烂变质食品的；
（3）载有废旧物品、有碍公共卫生物品的；
（4）来自检疫传染病或者监侧传染病疫区，并且装有易于隐匿、孳生病媒昆虫、医学动物的物品；
（5）被传染病污染或者有污染嫌疑的；
（6）其他经国务院卫生行政部门指定实施卫生处理的物品。
经卫生检疫机关卫生处理的集装箱，卫生检疫机关应当签发集装箱入境、出境卫生检疫许可证。
3.在国外或者国内有检疫传染病大流行的时候，卫生检疫机关根据国务院命令对集装箱及其所载货物，采取下列措施：
（1）禁止装载某些货物由国外运进或者收国内运出；
（2）指定某些集装箱必须经过卫生处理，方准由国外运进或者由国内运出。
4.卫生检疫机关对入境、出境集装箱实施卫生检查或者卫生处理的，根据国家规定的收费标准收取费用。
5.应注意的几个问题：
（1）集装箱到达或者离开港口、机场、车间、关口，在实施卫生检查以前，未经卫生检疫机关许可，不准启封或者转运。
（2）如果集装箱的承运人、代理人或者货主申请在其他地方实施卫生检查或者卫生处理。卫生检疫机关可以派员前往，所在地的运输管理部门或者货主，为卫生检疫机关提供工作场所，并配合其工作。
（3）对途径中华人民共和国运往其他国家或者地区的集装箱，不在境内启封的，除发生在流行病学上有重要意义的事件必须实施卫生处理外，一般不实施卫生处理。
