1、项目单位应当在货物进出口前，填写《进出口货物征免税申请表》，并持齐全有效单证向主管海关申请办理进出口货物减免税审批手续。未在货物进出口前向海关申请办理减免税审批手续，视作自动放弃其有关货物的减免税资格，海关应当不予办理其有关货物的减免税手续。
2、海关在受理进出口货物减免税手续前，审核所提交单证是否齐全、有效，各项数据填报是否规范，项目资金来源是否影响减免税货物的所有权。
海关受理项目单位申请后，审核申请减免税货物是否符合国家税收优惠政策规定，是否为不予免税商品，是否在减免税额度内，经审核无误后予以签发《征免税证明》，除另有规定外，有效期不超过半年。
3、项目单位因故需变更已签发的《征免税证明》中可直接变更的栏目的，应当向主管海关提出书面申请，海关审核同意后予以变更；
因故需变更其他栏目或作废已签发的《征免税证明》的，应向主管海关递交书面申请，海关审核同意后予以变更或作废，并收回作废的《征免税证明》。
项目单位不慎遗失已签发的《征免税证明》且需重新办理的，应向主管海关递交书面申请，海关审核同意并经核实《征免税证明》的使用情况后，应及时将尚未使用的原《征免税证明》的电子数据予以作废，并重新签发《征免税证明》。
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