各子系统的功能如果不均匀，物流系统的整体能力将受到影响。如装卸搬运能力很强，但运输力量不足，会产生设备和人力的浪费；反之如装卸搬运环节薄弱，车、船到达车站、港口后不能及时卸货，也会带来巨大的经济损失。
3.构成物流成本的各个环节费用之间的关系
如为了减少仓储费用降低库存而采取小批量订货策略，这将导致运输次数增加，也就是说运输费用将上升，因此运输费和保管费之间有相互制约关系。
4.各子系统的功能和所耗费用的关系
任何子系统功能的增加和完善必须投入资金。如信息系统功能的增加，必须购置硬件和开发计算机软件。增加仓库的容量和提高进出库速度，就要建设更大的库房并实现机械化、自动化。在改善物流系统的功能的项目中，投资额一定时，对各个子系统要合理进行分配。
知上所述的制约关系不胜枚举，这种制约关系也称为二律背反原理。因此在物流合理化过程中必须有系统观念，对这些相互制约的关系给予充分的注意。
