其次，运费的计算标准也不尽相同，例如重货一般按重量吨计收运费，轻抛货按尺码吨级计收，有些价值高的商品按FOB货值的一定百分比计收，有的商品按混合办法计收，例如先按重量吨或尺码吨计收，然后再加若干从价运费，表现在运价表中为：
一、按重量吨计收，称为重量吨，表内列明“W”，以每公吨或每长吨为计算单位。
二、按货物体积计收，称为尺码吨，表内列明“M”，一般按1立方米或40立方英尺为一尺码吨作为计算单位。
三、按体积或重量，由船方选择而计算，表内列为“W/M”。
四、按商品的FOB价值的一定百分比计收，称为从价运费(AdValorem),表内列明为AdVal或A.V.。
五.按混合标准计收，如W/MplusAV等。即按重量吨或尺码吨再加从价运费。此外，还有一些商品是按件(perunit)或头(perhead)计收，前者如车辆等，后者如活牲畜等。对于大宗商品，如粮食，矿石，煤炭等，因运量较大，货价较低，容易装卸等原因，船公司为了争取货源，可以与货主另行商定运价。
根据运价表计算运费，是一项比较复杂的工作，不仅需要熟悉运价表的基本内容，还需要细心工作，在计算运费时，除按照航线和商品的等级，先按基本费率(BasisRate)算出基本运费，然后还要查出各种附加费用的项目，并将需要支出的附加费一一计算在内。
这些附加费用项目较多，例如，因商品的不同，港口不同，或其他原因，都可能有附加费，还要随时掌握它的变动情况。
附加费大致有以下几种：
一、商品特点不同而增收的附加费，如超重附加费，超长附加费，洗舱费等。
二、因港口的不同情况而增收的附加费，如港口附加费、港口拥挤费、选港费、直航附加费等。
三、因其它原因而临时增加的附加费，如燃油附加费、贬值附加费等。
实际上附加费的名目繁多，远远不止上述这几种。值得注意的是，有些附加费，例如港口拥挤费，占运费的比例很大，与基本运费相比，少则百分之十，多则达百分之百，甚至两倍以上。因此，在计算运费时，不可忽视对附加费的计算。
现举一例说明。某轮从上海装运10吨，共计11.3立方米蛋制品，到英国普利茅斯港，要求直航，全部运费是多少?解：经查货物分级表可知，蛋制品是10级，计算标准是W/M;查中国-欧洲地中海航线等级费率表之10级货物的基本费率为116元/吨;经查附加费率表可知，普利茅斯港直航附加费，每计费吨为18元;燃油附加费为35%。所以，全部运费为：F=(116+116X35%+18)X11=1920.60元本例中，10吨蛋制品经查货物分级表，计算的标准是W/M,取其中较大者作为计算标准，则为11尺码吨。
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